MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis 8013

Total Repeats: 38881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017501	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385323173
2	NC_017501	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385323173
3	NC_017501	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323173
4	NC_017501	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385323173
5	NC_017501	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385323173
6	NC_017501	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385323173
7	NC_017501	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385323173
8	NC_017501	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323174
9	NC_017501	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	385323174
10	NC_017501	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323174
11	NC_017501	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385323174
12	NC_017501	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385323174
13	NC_017501	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	385323174
14	NC_017501	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323175
15	NC_017501	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323175
16	NC_017501	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323175
17	NC_017501	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323175
18	NC_017501	TCG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323175
19	NC_017501	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	385323175
20	NC_017501	GCTT	2	8	1283	1290	0 %	50 %	25 %	25 %	385323175
21	NC_017501	TGG	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385323175
22	NC_017501	T	6	6	1389	1394	0 %	100 %	0 %	0 %	385323175
23	NC_017501	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385323175
24	NC_017501	TCG	3	9	1471	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323175
25	NC_017501	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385323175
26	NC_017501	GC	3	6	1497	1502	0 %	0 %	50 %	50 %	385323175
27	NC_017501	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323175
28	NC_017501	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	385323175
29	NC_017501	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385323175
30	NC_017501	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323175
31	NC_017501	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323175
32	NC_017501	CAC	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385323175
33	NC_017501	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323175
34	NC_017501	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323175
35	NC_017501	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323175
36	NC_017501	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323175
37	NC_017501	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323175
38	NC_017501	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323175
39	NC_017501	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323175
40	NC_017501	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323175
41	NC_017501	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323175
42	NC_017501	CGG	2	6	2074	2079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323175
43	NC_017501	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323175
44	NC_017501	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323175
45	NC_017501	ATG	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323175
46	NC_017501	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323175
47	NC_017501	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323175
48	NC_017501	A	6	6	2523	2528	100 %	0 %	0 %	0 %	385323176
49	NC_017501	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323176
50	NC_017501	T	7	7	2590	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	385323176
51	NC_017501	TCC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385323176
52	NC_017501	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323176
53	NC_017501	CAC	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385323176
54	NC_017501	CGGA	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	385323176
55	NC_017501	TGT	2	6	2749	2754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385323176
56	NC_017501	GC	3	6	2801	2806	0 %	0 %	50 %	50 %	385323176
57	NC_017501	CCG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323176
58	NC_017501	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	385323176
59	NC_017501	CGG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323176
60	NC_017501	CGG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323176
61	NC_017501	GCCC	2	8	3031	3038	0 %	0 %	25 %	75 %	385323176
62	NC_017501	GCC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323177
63	NC_017501	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323177
64	NC_017501	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323177
65	NC_017501	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323177
66	NC_017501	CG	3	6	3339	3344	0 %	0 %	50 %	50 %	385323177
67	NC_017501	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385323177
68	NC_017501	GCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323177
69	NC_017501	GCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323177
70	NC_017501	TTC	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323177
71	NC_017501	GGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323177
72	NC_017501	TGC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323177
73	NC_017501	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323178
74	NC_017501	A	6	6	3844	3849	100 %	0 %	0 %	0 %	385323178
75	NC_017501	CAAA	2	8	3909	3916	75 %	0 %	0 %	25 %	385323178
76	NC_017501	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323178
77	NC_017501	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	385323178
78	NC_017501	CGG	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323179
79	NC_017501	A	6	6	4385	4390	100 %	0 %	0 %	0 %	385323179
80	NC_017501	ACCAA	2	10	4463	4472	60 %	0 %	0 %	40 %	385323179
81	NC_017501	CAA	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385323179
82	NC_017501	CCG	2	6	4637	4642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323179
83	NC_017501	GAA	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385323179
84	NC_017501	AAC	3	9	4734	4742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385323179
85	NC_017501	CGT	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323179
86	NC_017501	CTG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323179
87	NC_017501	CGA	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323179
88	NC_017501	CAT	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323179
89	NC_017501	GCC	2	6	4886	4891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323179
90	NC_017501	CAT	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323180
91	NC_017501	CGCA	2	8	4995	5002	25 %	0 %	25 %	50 %	385323180
92	NC_017501	AAC	2	6	5012	5017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385323180
93	NC_017501	CCT	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385323180
94	NC_017501	CCG	3	9	5168	5176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323180
95	NC_017501	CTG	2	6	5206	5211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323180
96	NC_017501	CG	3	6	5213	5218	0 %	0 %	50 %	50 %	385323180
97	NC_017501	ACA	2	6	5231	5236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385323180
98	NC_017501	AGA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385323180
99	NC_017501	GAA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385323180
100	NC_017501	CGCC	2	8	5363	5370	0 %	0 %	25 %	75 %	385323180
101	NC_017501	TTTC	2	8	5491	5498	0 %	75 %	0 %	25 %	385323180
102	NC_017501	AGA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385323180
103	NC_017501	GC	3	6	5597	5602	0 %	0 %	50 %	50 %	385323180
104	NC_017501	CGT	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323180
105	NC_017501	CCG	2	6	5616	5621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323180
106	NC_017501	CCG	3	9	5660	5668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323180
107	NC_017501	GCT	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323180
108	NC_017501	CT	3	6	5695	5700	0 %	50 %	0 %	50 %	385323180
109	NC_017501	TCT	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323180
110	NC_017501	CCA	2	6	5834	5839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385323180
111	NC_017501	A	6	6	5866	5871	100 %	0 %	0 %	0 %	385323180
112	NC_017501	T	6	6	6048	6053	0 %	100 %	0 %	0 %	385323181
113	NC_017501	TCA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323181
114	NC_017501	AAGGC	2	10	6080	6089	40 %	0 %	40 %	20 %	385323181
115	NC_017501	CG	3	6	6096	6101	0 %	0 %	50 %	50 %	385323181
116	NC_017501	GCAC	2	8	6153	6160	25 %	0 %	25 %	50 %	385323181
117	NC_017501	GCC	2	6	6175	6180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323181
118	NC_017501	CGG	2	6	6185	6190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323181
119	NC_017501	AAT	2	6	6209	6214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385323181
120	NC_017501	CGC	2	6	6283	6288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
121	NC_017501	GGCA	2	8	6308	6315	25 %	0 %	50 %	25 %	385323182
122	NC_017501	CGC	2	6	6346	6351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
123	NC_017501	CGC	2	6	6401	6406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
124	NC_017501	CGC	3	9	6415	6423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
125	NC_017501	GCTTT	2	10	6438	6447	0 %	60 %	20 %	20 %	385323182
126	NC_017501	GCC	2	6	6476	6481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
127	NC_017501	CGG	2	6	6535	6540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323182
128	NC_017501	GCG	3	9	6561	6569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323182
129	NC_017501	CGG	2	6	6643	6648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323182
130	NC_017501	ACG	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323182
131	NC_017501	TCGG	2	8	6672	6679	0 %	25 %	50 %	25 %	385323182
132	NC_017501	GCC	2	6	6692	6697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
133	NC_017501	GCC	2	6	6702	6707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
134	NC_017501	T	7	7	6721	6727	0 %	100 %	0 %	0 %	385323182
135	NC_017501	TTC	2	6	6731	6736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323182
136	NC_017501	CCG	3	9	6807	6815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323182
137	NC_017501	TGG	2	6	6865	6870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385323182
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139	NC_017501	GC	3	6	6905	6910	0 %	0 %	50 %	50 %	385323182
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143	NC_017501	TTG	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385323182
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179	NC_017501	TCAAT	2	10	9467	9476	40 %	40 %	0 %	20 %	385323184
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247	NC_017501	GGCA	2	8	12228	12235	25 %	0 %	50 %	25 %	385323187
248	NC_017501	GAT	2	6	12335	12340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323187
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260	NC_017501	ACAA	2	8	13065	13072	75 %	0 %	0 %	25 %	385323187
261	NC_017501	CCG	2	6	13100	13105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323187
262	NC_017501	TGTCG	2	10	13106	13115	0 %	40 %	40 %	20 %	385323187
263	NC_017501	GCC	2	6	13130	13135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323187
264	NC_017501	ATG	2	6	13143	13148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323187
265	NC_017501	CTT	2	6	13153	13158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323187
266	NC_017501	CAA	2	6	13160	13165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385323187
267	NC_017501	GTT	2	6	13174	13179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385323187
268	NC_017501	GTC	2	6	13187	13192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323187
269	NC_017501	ACC	2	6	13194	13199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385323187
270	NC_017501	CAT	3	9	13214	13222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323187
271	NC_017501	ATC	2	6	15005	15010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323188
272	NC_017501	CG	3	6	15059	15064	0 %	0 %	50 %	50 %	385323188
273	NC_017501	GTT	2	6	15074	15079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385323188
274	NC_017501	CGA	2	6	15130	15135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323188
275	NC_017501	GTC	2	6	15221	15226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323188
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278	NC_017501	GC	3	6	15273	15278	0 %	0 %	50 %	50 %	385323188
279	NC_017501	GC	6	12	15311	15322	0 %	0 %	50 %	50 %	385323188
280	NC_017501	TCG	2	6	15327	15332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323188
281	NC_017501	CTT	2	6	15460	15465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323188
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283	NC_017501	TAAA	2	8	15543	15550	75 %	25 %	0 %	0 %	385323188
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285	NC_017501	GGAA	2	8	15769	15776	50 %	0 %	50 %	0 %	385323188
286	NC_017501	GCA	2	6	15877	15882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323188
287	NC_017501	ATC	2	6	17004	17009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385323189
288	NC_017501	GTC	2	6	17046	17051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323189
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290	NC_017501	CGGTGG	3	18	17078	17095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385323189
291	NC_017501	T	6	6	17163	17168	0 %	100 %	0 %	0 %	385323189
292	NC_017501	GTT	2	6	17181	17186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385323189
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295	NC_017501	GCC	2	6	17422	17427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323189
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299	NC_017501	CGC	2	6	22020	22025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323190
300	NC_017501	CCG	2	6	22094	22099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323190
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304	NC_017501	CTT	2	6	22257	22262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323190
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323	NC_017501	CGGA	2	8	23181	23188	25 %	0 %	50 %	25 %	385323192
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375	NC_017501	GCT	2	6	25420	25425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323193
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377	NC_017501	TGTT	2	8	25488	25495	0 %	75 %	25 %	0 %	385323193
378	NC_017501	TAA	2	6	25515	25520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385323193
379	NC_017501	TTC	2	6	25562	25567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385323193
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381	NC_017501	GCA	2	6	25652	25657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323193
382	NC_017501	GTA	2	6	25658	25663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385323193
383	NC_017501	TGC	2	6	25741	25746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385323193
384	NC_017501	AGGGC	2	10	25756	25765	20 %	0 %	60 %	20 %	385323193
385	NC_017501	GAG	2	6	25986	25991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385323194
386	NC_017501	ACG	2	6	26011	26016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323194
387	NC_017501	TGG	2	6	26066	26071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385323194
388	NC_017501	CGC	3	9	26111	26119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385323194
389	NC_017501	GC	4	8	26118	26125	0 %	0 %	50 %	50 %	385323194
390	NC_017501	CGA	4	12	26177	26188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385323194
391	NC_017501	CCA	2	6	26204	26209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385323194
392	NC_017501	GC	3	6	26333	26338	0 %	0 %	50 %	50 %	385323194
393	NC_017501	GGC	2	6	26367	26372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385323194
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400	NC_017501	CGGTAT	2	12	26740	26751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385323194
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